Se cree que el libro de texto fundamental rGyud-bZhi (Cuatro Tantras) de Sowa-Rigpa fue enseñado por el Buda y, por lo tanto, está estrechamente relacionado con la filosofía budista. En consecuencia, se cree que los seres incluso en su estado saludable están 'enfermos' hasta el logro del Nirvana y aunque la enfermedad no sea manifiesta, siempre está presente en forma latente hasta que uno elimina la causa raíz de la enfermedad, es decir, 'Ignorancia'. La ignorancia da lugar a tres causas básicas de la enfermedad, es decir, hDod-Chhags (deseo/lujuria) causa raíz de rlung (Vata, energía eólica), Zhe-sDang (ira) causa raíz de mkhris-Pa (Pitta, Bile/energía térmica) y gTi-Mug (oscuridad mental) causa raíz de Bad-Kan (Kapha, flema/energía fría). Todos los fenómenos animados e inanimados del universo están compuestos de la misma materia basada en hByung-Ba-lNga (cinco elementos) Dependiente del Karma de todos los seres vivos. El comportamiento y la conducta del médico y el paciente también se basan en gran medida en principios budistas. Los rituales budistas Tantra y Mantra juegan un papel muy importante en el tratamiento de los pacientes.

Según los principios de hByung-Ba-lNga y Nyes-Pa-gSum, todos los fenómenos de este universo están compuestos de hByung-Ba-lNga; a saber, Sa, Chhu, Me, rLung y Nam-mkhah (traducidos aproximadamente como tierra, agua, fuego, viento y espacio o Dharti, Jal, Agni, Vayu y Akash). La ciencia de la fisiología, patología y farmacología de este sistema se establecen en estas teorías. Esto significa que el cuerpo humano está compuesto de estos cinco elementos cosmo-físicos del hByung-Ba-lNga; y cualquier desequilibrio en la proporción de estos elementos en nuestro cuerpo resulta en trastornos. El medicamento y la dieta utilizados para el tratamiento de trastornos también están compuestos por los mismos cinco elementos. En nuestro cuerpo estos elementos están presentes en forma de tres energías llamadas Nyes-Pa-gSum (tres humores), siete constituyentes físicos/ Sapt Dhatu llamado Lus-Zungs-bDunand, tres excreciones o Tri-mala llamada Dri-Ma-gSum. En medicamentos, productos dietéticos y bebidas, existen en forma de Ro-Drug (seis sabores) Nus-Pa-brGyad (ocho potencias), Yon-Tan-bChu-bDun (diecisiete cualidades/ propiedades) y Zhu-rJes-gSum (tres sabores post-digestivos). En vista de esta teoría, un médico utilizaría sus conocimientos, habilidades y experiencia en el tratamiento de un paciente utilizando la teoría de similitud y dissimilaridad de cinco elementos.

Un cuerpo sano se tipifica como un estado de equilibrio de tres humores (Nyes-Pa-gSum), siete constituyentes físicos (Lus-zungs-bDdun) y tres excreciones (Dri-Ma-gSum) en el cuerpo con completa armonía de cinco agregados (cinco sentidos). Los tres humores son el viento (rlung), la bilis (mkhris-pa) y la flema (bad-kan) que se clasifican en cinco tipos diferentes para cada humor. Siete constituyentes físicos son la esencia nutricional, la sangre, el tejido muscular, el tejido graso, el tejido óseo, la médula o sea y el líquido regenerativo; las tres excreciones son heces, orina y sudor. Los humores son la representación biológica de cinco elementos, los constituyentes físicos son los elementos básicos del tejido del cuerpo y las excreciones son el producto de desecho del cuerpo cuya eliminación adecuada es esencial para una buena salud. Si el estado de un cuerpo es saludable o no, depende en gran medida del equilibrio y desequilibrio de estos veinticinco elementos basados en una dieta adecuada y patrones de comportamiento. El tema del cuerpo humano se explica en Sowa-Rigpa con gran detalle con diferentes capítulos sobre embriología, anatomía, fisiología, neurología, etc., explicados de manera apropiada con las funciones de cada una y todas las partes del cuerpo.

Sowa-Rigpa está estrechamente relacionado con la filosofía budista, donde se cree que todas las criaturas que respiran en la tierra están enfermas hasta la causa raíz, es decir, la ignorancia se elimina. Debido a la ignorancia nacen con nosotros tres venenos mentales: ira, deseo y oscuridad mental - y actúan como los orígenes básicos de la enfermedad. Cuando la relación de tres humores - viento, bilis y flema - está desequilibrada debido a condiciones circunstanciales como dieta, estilo de vida, estacionales y mentales, da lugar a diferentes tipos de trastornos. Las enfermedades pueden clasificarse por diferentes medios como ubicación en el cuerpo, tipo, etc. La presencia de 84 mil tipos diferentes de emociones aflictivas en la mente da lugar a 84 mil tipos diferentes de enfermedades. Estos pueden ser condensados en 1016 clases, más lejos en 404 clases, y después en 101 clases, en tres humores y finalmente en dos clases, a saber desórdenes calientes y fríos.