La palabra Siddha tiene su origen en la palabra tamil "Siddhi" que significa "un objeto a ser alcanzado" o "perfección" o "bienaventuranza celestial". India siendo el lugar de nacimiento de muchas filosofías tradicionales también dio a luz a Siddha.

Se cree que el sistema de medicina fue predicado por el Señor Shiva a su consorte Paarvathi, luego por Ella a Nanthithevar (la montura sagrada del Señor Shiva) quien transmitió el conocimiento de Siddha a Siddhars para el beneficio de la humanidad. Los Siddhars son personas que han alcanzado la bienaventuranza celestial (Siddhi). Ellos desarrollaron y practicaron los ocho niveles de Yogam para alcanzar la bienaventuranza eterna, es decir, Attaanga Yogam.

Estos ocho niveles son:

Iyamam	Buen pensamiento
Niyamam	Buenas obras
Aasanam	La postura del cuerpo
Praanaayaamam	control de la respiracion
Prathiyaakaaram	Restricción de los sentidos de sus objetos de disfrute
Thaaranai	concentración de la mente
Thyaanam	meditacion profunda
Samaadhi	Superconsciencia

También se decía que los Siddhars poseían ocho poderes extraordinarios llamados Attamaasiddhigal, que son Animaa, Magimaa, Lagimaa, Karimaa, Praapthi, Prakaamiyam, Vasithuvam y Eesathuvam. Se considera que muchos Siddhars han contribuido al sistema de medicina Siddha y, entre ellos, se considera que Agathiyar es el Siddhar más importante. Sus aportaciones se clasificaron principalmente en las cuatro categorías siguientes:

i.       Gnanam          conocimientos espirituales

ii.       Yogam            Principios yóguicos, técnicas de meditación

iii.      Vaatham         Alquimia y prácticas similares

iv.     Vaithiyam        Alquimia y prácticas similares

Cada una de estas prácticas está dirigida hacia el mantenimiento de un cuerpo sano y una mente sana que forma la base para alcanzar la bienaventuranza eterna. El sistema de Siddha en su enfoque único hace hincapié en varios regímenes rutinarios y estacionales como medidas preventivas contra las enfermedades del cuerpo y la mente. Este sistema pone un énfasis significativo en la dieta, ya que juega un papel muy importante en el mantenimiento de un cuerpo sano - la base que nutre una mente sana.

La base del sistema de Siddha es la doctrina fisiológica de tres humores viz. Vali, Azhal y Aiyam colectivamente conocidos como Uyir Thaathukkal. En consecuencia, se considera que cada individuo tiene una composición corporal única y este sistema de medicina tiene un enfoque individualista en la preservación de la salud.