Les méthodes de traitement de Sowa-Rigpa comportent quatre sections principales: le régime alimentaire, le comportement, la médecine et les thérapies accessoires/externes. L'administration correcte de ces quatre sections est très importante pour traiter un patient de manière appropriée. Les affections mineures peuvent être traitées simplement par un régime alimentaire et un comportement appropriés; un patient atteint d'une maladie moyenne peut être traité par des médicaments tels que décoction, poudre, pilules, purges, vomissements, etc.; tandis que les patients à un stade avancé de la maladie peuvent être guéris par l'application de thérapies accessoires/externes telles que le moxa et la cautérisation, la saignée, la fomentation, le massage, la chirurgie, etc. Les rituels tantriques bouddhistes jouent un rôle très important dans le traitement des maladies. Les rituels tantriques bouddhistes jouent un rôle très important dans le traitement des maladies. On sait que le rôle du médecin est très important dans le traitement d'un patient; c'est pourquoi ce système de médecine met particulièrement l'accent sur cet aspect.